1. 단백체 및 수식화 단백체의 이종 데이터 통합 분석을 위한 데이터 분석 파이프라인

a. PTMOmics pipeline은 글로벌 단백체 데이터에서 수식화 정보 도출을 위한 것으로 단백체 실험 후 확인된 단백질 목록에 대해 Metascape (https://metascape.org)를 이용하는 Gene list analysis의 결과물인 Enriched Ontology(EO) cluster를 Cytoscape (https://cytoscape.org)에서 읽은 GONetwork에 포함된 단백질 목록 (***.CSV 파일)을 입력값으로 합니다.

b. PTMSpectralSearch는 수식화(인산화)펩타이드 ID를 위한 것으로 탄뎀질량분석후 얻어진 raw 파일을 mzML이나 MS2로 컨버팅 후 사용가능합니다.

2. 입력 데이터

a. PTMOmics pipeline: CSV 파일

b. PTMSpectralSearch: RAW데이터에서 변환된 탄뎀질량스펙트럼의 MS2파일

3. 출력 데이터

a. PTMOmics pipeline: protein list (xlsx)

b. PTMSpectralSearch:, peptide list (xlsx), ID peptide tandem mass spectrum image

 4. 설치 및 사용 방법: 매뉴얼

5. Citation 방법: The data analysis was performed using a PTMOmics pipeline.

6. 대표이미지